中華民國在二次大戰結束後，對於琉球群島（沖繩）的主權歸屬，並不承認是日本國所有。中華民國政府認為，琉球群島主權問題，應該依據波茨坦宣言與對日舊金山和約的精神處理，由二戰同盟國議定。但是2000年後，民進黨與國民黨政府都採取媚日外交路線，對日外交路線大調整，放棄了中華民國政府長期的主張，承認日本對於琉球的主權。
就中華民國政府最初的認知，琉球群島是日本強占，並非原先日本領土。所以在二次大戰結束後，中華民國始終主張日本對於琉球群島並沒有主權。
在民國42年，美國決定將琉球群島的一部分奄美群島交還日本時，當時的立法院曾經決議，我國的態度應該依據舊金山和約第三條處理。根據外交部年鑑，那時的外交部長葉公超曾公開發表聲明，對於美國的處置表示遺憾。外交部發言人也代表政府發表聲明，希望按照舊金山和約精神辦理。
因為政府不承認日本對琉球群島有主權，中華民國與日本有邦交的年代中，是在琉球成立中琉文化經濟協會作為交涉機構，雖然中華民國在東京有大使館，中琉文化經濟協會並不歸屬大使館管轄範圍。
民國60年，美國政府正式移交琉球群島給日本政府，當時外交部發表聲明，認為日本主權僅及於本州、北海道、九州、四國，及其他二戰主要盟國決定的其他小島，琉球群島的未來地位，應該由二戰主要盟國決定，中華民國主張琉球最後處置，應該由同盟國依據開羅宣言、波茨坦宣言協商決定，中華民國不滿美國沒有經過協商，將琉球交給日本。
中華民國對於琉球群島問題的看法，直到民國95年民進黨執政期間，出現了重大變化，當時民進黨政府假藉正名運動，偷偷摸摸地將中琉文化經濟協會改為那霸辦事處，歸駐日代表處管轄。當時外交部一度擔心引起國內反彈，利用例行記者會簡單地對外發布非常簡短的訊息，並沒有受到台灣媒體的注意，只有日籍記者發現這個外交路線的大退讓。
這是中華民國對日交涉的重大讓步，民進黨政府採行媚日外交路線，當時外交部日本事務會執行長羅燦坤（現任駐日副代表）狡辯外交部從來沒有否認日方擁有琉球主權，但是對照先前外交部的聲明，以及立法院的決議，都可以看到政府認為琉球主權最後歸屬是需要由二戰同盟國商討決定，顯然與羅所言不同。
民進黨放棄對日主張，到了民國97年馬英九總統執政後，馬政府依舊續行這項對日措施，沒有重新回到原先國民黨政府長期以來的政治立場。
（2011年5月4日）
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